黑龍江干岔子省級保護區成立于2011年，為內陸濕地與水域類型自然保護區，重點保護對象為內陸濕地與水域生態系統及珍稀野生動植物資源。保護區地處小興安嶺北麓的黑龍江省遜克縣境內，東與遜克縣苗圃接壤，南以遜別拉河為界，西與孫吳縣相連，北與俄羅斯以黑龍江為界，地理坐標為：北緯49°24′54″～49°35′03″，東經127°48′34″～128°18′59″，總面積26615 公頃，其中核心區面積9465公頃，占保護區面積的35.56%，緩沖區面積7894公頃，占保護區總面積的29.66%，實驗區面積9256公頃，占總面積的34.78%。
保護區有5個植被型，5個植被亞型，12個群系組，20個群系和32個群叢組或群叢。區內共有高等植物658種，其中苔蘚植物19科34屬59種，蕨類植物10科13屬24種，種子植物80科274屬575種，包括野大豆、黃檗、鉆天柳、水曲柳和紫椴等國家Ⅱ級保護植物5種；有脊椎動物308種，其中魚類58種，兩棲類動物7種，爬行類動物9種，鳥類191種，哺乳類43種，包括東方白鸛、白頭鶴、金雕、丹頂鶴、紫貂等國家Ⅰ級保護野生動物5種和棕熊、猞猁、駝鹿、鴛鴦、花尾榛雞等國家Ⅱ級保護野生動物33種。
保護區與俄羅斯阿穆爾州級自然保護區隔江相望，是白頭鶴、東方白鸛等珍禽重要的棲息地，也是駝鹿、棕熊等大型獸類遷徙的重要通道。保護區生態系統類型保存完整，地理區位重要，景觀獨特，珍稀物種集中多樣，是集生物多樣性保護、科學研究、生態旅游和可持續利用于一體的自然保護區，也是中俄兩國跨境自然保護區建設重要的節點區域，具有極高的保護價值。