黑龍江倭肯河自然保護區屬于“自然生態系統類”中的“內陸濕地與水域生態系統類型”的自然保護區。保護區位于黑龍江省七臺河市，倭肯河中上游。地理坐標為：45°56′48″～46°03′26″N，131°01′31″～131°15′24″E。保護區北隔金沙河與樺南林業局相鄰，東、南、西三面與七臺河市種蓄場相接壤。保護區東西長17.8km，南北寬12.6 km，總面積為7387 hm2。保護區共分三個功能區，分別是核心區面積2607 hm2；緩沖區面積2606 hm2；實驗區為面積2174 hm2。
保護區內分布著大面積原生性的沼澤濕地生態系統，主要類型有森林沼澤、灌叢沼澤和草本沼澤等。保護區共有高等植物125科290屬495種，有國家Ⅱ級重點保護野生植物5種，即紫椴、黃檗、水曲柳、野大豆和蓮。保護區共有脊椎動物336種，國家Ⅰ級保護動物4種，東方白鸛、丹頂鶴等，還有馬鹿、花尾榛雞、鴛鴦、松雀鷹等國家Ⅱ級保護動物40種。倭肯河省級自然保護區是三江平原地區保存完整、面積較大的沼澤濕地，野生動植物資源十分豐富，是重要的野生生物種源基地和基因庫，是一處天然的動植物園和理想的科研、宣教基地。