玉峰遺址位于玉峰山西山南，因在玉峰山附近發現而命名為玉峰遺址,為新石器時代古人類活動文化遺址.遺址面積1000平方米，中部圓形土臺高出地表7.8米，面積約366平方米。1992年11月修筑公路取土時發現。采集到大量馬家浜文化紅陶片、黑陶片、灰陶器殘片，崧澤文化黑皮陶片、灰陶片和良渚文化石斧、石錛共11件，現存部分高地。2004年7月公布為昆山市第三批文物保護單位。
據了解，玉峰山、綽墩山、趙陵山、少卿山、黃泥山、太史淀等地均留有遠古先民印跡。6500年前，東海海面有一次波動下降的過程，海水東退，海平面比現在低于3~4米。那時候，昆山的先民從地勢較高的馬鞍山南麓(玉峰遺址)逐漸向綽墩山等靠近湖泊的地區轉移，開始了定居生活，玉峰遺址是昆山原始先民最早生活的地方。