蘭溪藥皇廟位于蘭溪市云山街道，年代為清。
牛角尖雀門巷23號，就是藥皇廟。藥皇廟共三進，占地1100平方米。前有磚雕門樓，上 書-“藥皇廟”三字，正殿面闊五間，梁、檁、枋、牛腿等構件，皆雕刻大量人物、花卉和鳥獸等圖案，供奉祖師神農。
根據道光三十年（公元1851年）立的《重建瀫西藥業公所碑記》記載，早在乾隆九年（公元1744年），當地的徐公質亭、湯公制菴兩人倡議捐資建廟于邑城之三坊，之后，蘭溪又建起了瀫西藥業公所。
1996年10月3日公布為蘭溪市級文物保護單位。
2017年1月13日，浙江省人民政府公布為第七批浙江省文物保護單位。