菜園遺址位于寧夏回族自治區中衛市，是新石器時期最為典型的遺址，1987年大規模發掘全面展開，歷時4年。
遺址群包括馬纓子梁、石溝、林子梁3處遺址，切刀把、寨子梁、二領子灣、瓦罐嘴和林子梁西坡5處墓群，距今約4500年，屬新石器晚期文化遺存。發現了上百座墓葬、十幾座房址和幾十個灰坑窖穴，同時出土的還有大量陶器、石器、骨器和漆器等。
考古界一致認為，菜園遺址的發掘，對研究西北地區新石器時代文化具有極為重要的參考價值，特別是對居址、葬俗、燈具等方面的研究提供了重要的實物資料。同時，林子梁遺址窯洞式房屋類型之多，保存之好，為中國古代建筑史上罕見，堪稱古建筑史的一次重大發現。
2006年5月，菜園遺址作為新石器時期遺址，被國務院公布為第六批全國重點文物保護單位。