同文書院位于江西九江。清同治六年(1867)美國傳教士爾利陶理、吳恪矩等經清政府同意創建于城外土橋，命名為“埠閬小學”。后來隨著學校規模的擴大，學校選擇城內南門口甘棠湖畔為新校址，并取《中庸》“普天之下，車同軌，書同文”之意，定名為“同文書院”，為江西省第一所教會書校。教授內容除近代文化科學知識外，還注重宗教教育。1906年，校長庫思飛在該地挖地基的時候，挖出三大壇唐開元古錢，他把這些古錢拿到美國換得巨款，加上美國教會本身籌集的一部分錢，建教學樓(今九江二中實驗樓)，并更名為南偉烈大學，以紀念其父。1917年停辦大學，集中精力專辦九江南偉烈中學。1929年，“南偉烈中學”更名為九江同文中學。1951年6月11日，改名江西省立潯陽中學。1959-1962年，一度在此辦九江大學。現為江西省級文物保護建筑，為九江二中(同文中學)所在地。
書院分設小學部、中學部、神學部、大學部等四組。學期小學3年，中學4年，神學2年，大學2年。建院初期書院有外國教師4名，中國教師8名，學生80余名。每位學生1年學費食費合計60元。書院經營除收取學生費用外，美以傳道會每年補助一萬二千元。
2013年5月，國務院（國發[2013]13號）公布九江同文書院為第七批全國重點文物保護單位。