蘭坪縣是怒江州內最早有人類活動的地區之一，新石器文化遺址眾多，以玉水坪和馬鞍山兩處遺址冠首。
玉水坪遺址位于蘭坪縣通甸鄉下甸村玉水坪社北面公路右上方的金雞巖上，是一高1.5米、寬4.7米、長8.8米的洞穴。遺址文化層厚65公分。1976年首次發現。從1984年開始發掘至今，共采集到飾品7件、石斧1件、石錛2件、夾沙灰陶數片。據考證，玉水坪洞穴遺址系新石器文化遺址，距今約4000年。1986年公布為蘭坪縣級重點文物保護單位，1993年公布為怒江州級重點文物保護單位，保護范圍面積172903.325平方米。
馬鞍山文化遺址位于蘭坪縣金頂鎮文興街永安村以南1公里處。遺址文化層距地表80至100厘米，文化層厚約60至80厘米。1974年首次發現，有關部門從1984年8月開始調查發掘，共采集到石斧16件、石錛3件、孔石刀18件，以及碗、杯、壺、罐等器物14件。經考證系新石器文化遺址。1986年公布為蘭坪縣級重點文物保護單位，1993年公布為怒江州級重點文物保護單位，保護范圍面積8000平方米。