玉清宮坐落在青城山丈人峰北坡。從圓明宮往西南上行里許即到。它古為天真觀，祀天皇真人，載于清乾隆《灌縣志》，古廟被毀。
1938年成都慈善會在舊址上重建，取名玉清宮，有殿宇兩重：上殿供奉呂祖、邱祖；中殿供奉祀寧封真人和藥王孫真人。傳說孫思邈晚年曾居青城山，并在此完成著名的《千金要方》。附近還有明代三官堂遺址。
殿內有于右任先生1946年所題“玉清道院”匾額和劉咸滎、方旭等人的題詩。
玉清宮環境幽靜，在殿前平臺上，視野開闊，可俯視山下百里平疇。抗戰期間，陳銘樞將軍曾來此游覽，留下詩作：“虎據龍蟠毒霧封，迢遙寄恨上高峰。蜀中弟子新仍銳，東下貔貅怒發沖。”宮左保坎下有“蓮蕊石”（天然礫石，形如蓮花）。宮后有“天然泉”，傳為天皇真人飲水處。