萬石蓮寺位于“萬笏朝天”巨石的下方，由于寺周多巨石，故得此名。它相傳為唐代開元年間中原陳氏入島開發時所建，是廈門島上最早的寺廟之一，距今已有1000多年的歷史了。后來幾經興廢，重修了幾次。現在這個樣子是廈門開放后由新加坡佛教總會會長宏船法師重修的。
從山下到萬石蓮寺需經海會橋，過海會橋后為山門，拾級而上，迎面為石坊，石坊上的楹聯“一句彌陀聲傳鷺島，千年常住業紹廬山”，是弘一法師為會泉法師中興萬石巖而寫的。石坊內是主殿大雄寶殿，殿內有萬石蓮寺把奉的西方三圣的佛像，因而此地又叫“小西天”。大殿左側有洞門可入，走過洞門就是會泉法師的紀念室，再后面就是念佛堂，堂匾是弘一法師所寫，當年弘一法師就是在此講經的。紀念堂前，有塊巨石一“聆妙石”，石上龍須虬根，蟠石而生，榕叉里又有一株寄生樹，這就是樹包石、樹包樹的奇特景觀。“聆妙石”對面還有一塊巨石，有石步可以攀登，登上石頂可覽植物園西半園主景、遠眺市區的繁華。
地址：廈門市思明區虎園路25號廈門園林植物園（萬石植物園）內
類型：寺廟
游玩時間：建議1小時
電話：0592-2022159
開放時間：
春夏（5月1日-10月7日）5:30-18:30，秋冬（10月8日-次年4月30日）6:30-18:00。
門票信息：
無需門票。包含在廈門園林植物園（萬石植物園）門票內