湖州市博物館創建于1962年10月，原名吳興縣博物館，1983年撤地建市時改稱現名，原址在公園路80號錢業會館內，2003年3月新館動工興建，2004年10月交付使用。
湖州市博物館是一家承擔全市文物保護、考古調查與發掘任務，集收藏、研究、展示于一體的地市級中型綜合性博物館，為省級愛國主義教育基地，現有藏品從不同側面反映了湖州各個歷史時期的文化風貌。
湖州市博物館功能定位將是以江南太湖地區“人地關系”的演變為背景，以山水與人文、生態與文化交融一體這一湖州人文物質為主題，以提高公眾文化素養，培養市民愛國愛鄉情結、拓展人文湖州品牌為宗旨，把湖州博物館辦成集藏品研究、展覽教育、文化交流、智性休閑為一體的多角度的現代化地志類博物館，使之成為湖州對外宣傳的閃光平臺、來賓與游客概覽湖州的首選視窗，市民與學生向往的公共、文化休閑中心。