高郵市博物館是一座具有地方特色的國有綜合類博物館，坐落于城市商務大廈東側，于2017年完成布展并免費對公眾開放。主館基本陳列分為《高郵通史陳列》和《里下河民俗風情展》兩個板塊。
其中，《高郵通史陳列》依據不同時期，從新石器時代開始，依次布展了龍虬莊遺址、唐王墩遺址、周邶墩遺址、天山漢墓、邵家溝遺址、大墩漢墓群、騎龍墓群、大運河、三垛集鎮遺址、陶河遺址等出土的精美文物，綜合運用聲光電等現代化設施，全面展示了高郵地區的文明進程。《里下河民俗風情展》部分以兩條古街、一個城鄉接合部，展示上個世紀三十至四十年代高郵的風俗民情，體現形式由街市店鋪、街面活動、臨水廣場、水中勞作等場景組成。
另外，館內還設立體驗區，豐富觀眾觀展體驗。